Liberec se po Mnichovské dohodě stal hlavním městem nové říšské župy Sudety a sídlem Konrada Henleina. Z dostupných pramenů je zřejmé, že "arizace" židovského majetku a vyhánění Židů zde probíhalo velmi rychle. Již před "křišťálovou nocí" velká část zdejších Židů utekla do vnitrozemí, synagoga již byla uzavřena.

11. listopadu 1938 v ranních hodinách byla vypálena synagoga postavená v neorenesančním slohu na velmi reprezentativním místě v centru čerstvě přestavěného Liberce v letech 1887-88. Fotografie ukazují zástup přihližejících, kteří požár synagogy sledovali. Trosky synagogy byly strženy v roce 1939, na jejím místě vzniklo parkoviště.

V současnosti na místě bývalé synagogy stojí moderní Krajská vědecká knihovna, v jejímž rohu se též nachází malá synagoga, jež slouží současné židovské obci v Liberci, připomíná bývalý význam židovské komunity v tomto městě a v neposlední řadě i událostí "křišťálové noci".